MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseburia hominis A2-183 chromosome

Total Repeats: 68031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015977	TGA	2	6	35	40	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
2	NC_015977	AT	3	6	129	134	50 %	50 %	0 %	0 %	347530299
3	NC_015977	AAG	2	6	175	180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
4	NC_015977	TTC	2	6	245	250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530299
5	NC_015977	CTT	2	6	272	277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530299
6	NC_015977	TAA	2	6	282	287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530299
7	NC_015977	AAT	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530299
8	NC_015977	TC	3	6	397	402	0 %	50 %	0 %	50 %	347530299
9	NC_015977	CT	3	6	437	442	0 %	50 %	0 %	50 %	347530299
10	NC_015977	GGA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530299
11	NC_015977	TGA	2	6	641	646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
12	NC_015977	GAT	2	6	649	654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
13	NC_015977	TAT	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530299
14	NC_015977	GAA	2	6	688	693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
15	NC_015977	CCG	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530299
16	NC_015977	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530299
17	NC_015977	GCC	2	6	756	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530299
18	NC_015977	GAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
19	NC_015977	ATGAA	2	10	884	893	60 %	20 %	20 %	0 %	347530299
20	NC_015977	CGA	2	6	900	905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530299
21	NC_015977	CAAC	2	8	923	930	50 %	0 %	0 %	50 %	347530299
22	NC_015977	ATC	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530299
23	NC_015977	TTA	2	6	1082	1087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530299
24	NC_015977	GAT	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530299
25	NC_015977	AC	3	6	1205	1210	50 %	0 %	0 %	50 %	347530299
26	NC_015977	GCT	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530299
27	NC_015977	CGG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530299
28	NC_015977	CAT	2	6	1257	1262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530299
29	NC_015977	AGA	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530299
30	NC_015977	GACGA	2	10	1300	1309	40 %	0 %	40 %	20 %	347530299
31	NC_015977	CAAAT	2	10	1704	1713	60 %	20 %	0 %	20 %	347530300
32	NC_015977	TGAT	2	8	1787	1794	25 %	50 %	25 %	0 %	347530300
33	NC_015977	TGT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347530300
34	NC_015977	GAC	2	6	1971	1976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530300
35	NC_015977	GAT	2	6	2023	2028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530300
36	NC_015977	GA	3	6	2050	2055	50 %	0 %	50 %	0 %	347530300
37	NC_015977	AAG	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530300
38	NC_015977	TCT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530300
39	NC_015977	GAG	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530300
40	NC_015977	TC	3	6	2194	2199	0 %	50 %	0 %	50 %	347530300
41	NC_015977	AAG	2	6	2254	2259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530300
42	NC_015977	TTC	2	6	2300	2305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530300
43	NC_015977	GGA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530300
44	NC_015977	ATTTGA	2	12	2358	2369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347530300
45	NC_015977	CTC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347530300
46	NC_015977	CAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530300
47	NC_015977	CTC	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347530300
48	NC_015977	ATC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530300
49	NC_015977	ATGA	2	8	2590	2597	50 %	25 %	25 %	0 %	347530300
50	NC_015977	GATATT	2	12	2599	2610	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347530300
51	NC_015977	TTC	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530300
52	NC_015977	GAG	3	9	2683	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530300
53	NC_015977	GAT	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530300
54	NC_015977	GAT	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530301
55	NC_015977	TCA	2	6	2854	2859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530301
56	NC_015977	A	6	6	2877	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	347530301
57	NC_015977	AG	3	6	2965	2970	50 %	0 %	50 %	0 %	347530301
58	NC_015977	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	347530301
59	NC_015977	CGG	2	6	2984	2989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530301
60	NC_015977	TGA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530302
61	NC_015977	AT	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	347530302
62	NC_015977	GAT	2	6	3208	3213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530302
63	NC_015977	GAA	2	6	3227	3232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530302
64	NC_015977	GA	3	6	3265	3270	50 %	0 %	50 %	0 %	347530302
65	NC_015977	GAA	3	9	3292	3300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530302
66	NC_015977	A	6	6	3338	3343	100 %	0 %	0 %	0 %	347530302
67	NC_015977	T	7	7	3377	3383	0 %	100 %	0 %	0 %	347530302
68	NC_015977	CGG	2	6	3417	3422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530302
69	NC_015977	GGATC	2	10	3460	3469	20 %	20 %	40 %	20 %	347530302
70	NC_015977	AGCGC	2	10	3505	3514	20 %	0 %	40 %	40 %	347530302
71	NC_015977	GAA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530302
72	NC_015977	ATC	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530302
73	NC_015977	CGG	2	6	3676	3681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530302
74	NC_015977	T	7	7	3693	3699	0 %	100 %	0 %	0 %	347530302
75	NC_015977	CGA	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
76	NC_015977	T	6	6	3728	3733	0 %	100 %	0 %	0 %	347530302
77	NC_015977	GAC	2	6	3803	3808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
78	NC_015977	CTG	2	6	3809	3814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530302
79	NC_015977	CAG	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
80	NC_015977	TGC	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530302
81	NC_015977	GAT	2	6	3947	3952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530302
82	NC_015977	CAG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530302
83	NC_015977	CTG	2	6	3989	3994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530302
84	NC_015977	CAT	2	6	4018	4023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530302
85	NC_015977	TCA	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
86	NC_015977	TGA	2	6	4312	4317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530303
87	NC_015977	GGA	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530303
88	NC_015977	GACG	2	8	4388	4395	25 %	0 %	50 %	25 %	347530303
89	NC_015977	CGG	2	6	4468	4473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
90	NC_015977	GGC	3	9	4481	4489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
91	NC_015977	CGG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
92	NC_015977	AC	3	6	4814	4819	50 %	0 %	0 %	50 %	347530303
93	NC_015977	GCA	2	6	4945	4950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
94	NC_015977	ATG	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530303
95	NC_015977	AAT	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347530303
96	NC_015977	ATC	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
97	NC_015977	ATC	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
98	NC_015977	GAG	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530303
99	NC_015977	AGC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
100	NC_015977	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
101	NC_015977	GC	3	6	5314	5319	0 %	0 %	50 %	50 %	347530303
102	NC_015977	GCG	2	6	5327	5332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347530303
103	NC_015977	AGA	2	6	5354	5359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
104	NC_015977	GAA	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
105	NC_015977	CCG	2	6	5457	5462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530303
106	NC_015977	GAT	2	6	5584	5589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530303
107	NC_015977	ACA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530303
108	NC_015977	ATC	3	9	5651	5659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347530303
109	NC_015977	CCGATG	2	12	5664	5675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347530303
110	NC_015977	CCG	2	6	5768	5773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530303
111	NC_015977	GAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530303
112	NC_015977	ACG	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
113	NC_015977	CAA	3	9	5863	5871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530303
114	NC_015977	GATG	2	8	5899	5906	25 %	25 %	50 %	0 %	347530303
115	NC_015977	AGC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
116	NC_015977	GAC	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
117	NC_015977	TGAT	2	8	5964	5971	25 %	50 %	25 %	0 %	347530303
118	NC_015977	TTC	2	6	5980	5985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347530303
119	NC_015977	ACG	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347530303
120	NC_015977	ATG	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
121	NC_015977	GAA	2	6	6182	6187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
122	NC_015977	AAC	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347530304
123	NC_015977	TCG	2	6	6349	6354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530304
124	NC_015977	GCT	3	9	6492	6500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347530304
125	NC_015977	TGA	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347530304
126	NC_015977	TTA	2	6	6712	6717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347530304
127	NC_015977	GAG	2	6	6774	6779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347530304
128	NC_015977	CCG	2	6	6835	6840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530304
129	NC_015977	ACCGG	2	10	6856	6865	20 %	0 %	40 %	40 %	347530304
130	NC_015977	CG	3	6	6885	6890	0 %	0 %	50 %	50 %	347530304
131	NC_015977	CCG	2	6	7076	7081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347530304
132	NC_015977	CA	4	8	7122	7129	50 %	0 %	0 %	50 %	347530304
133	NC_015977	GAA	2	6	7230	7235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347530304
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